Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms