Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cdkn1bP46414 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms