Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NodalP43021 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NodalP43021 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms