Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms