Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mmp9P41245 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms