Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtbP41155 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtbP41155 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms