Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprkP35822 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprkP35822 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms