Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nedd1P33215 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms