Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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