Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcdP28867 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrkcdP28867 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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