Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprmP28828 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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