Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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