Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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