Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a1P19437 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a1P19437 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms