Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18530 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P18530 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P18530 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P18530 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms