Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18524 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18524 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18524 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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