Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms