Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P10404 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P10404 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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P10404 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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