Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2-Ab1P01921 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms