Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01661 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms