Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vamp4O70480 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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