Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan6O70401 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms