Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgceO70258 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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