Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DffaO54786 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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DffaO54786 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DffaO54786 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
DffaO54786 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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