Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Foxd2O35392 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Foxd2O35392 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms