Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ColqO35348 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms