Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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