Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih2O35089 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnih2O35089 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms