Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Q1O19441 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms