Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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