Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Slc14a1-202ENSMUST00000160292 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 2610042L04Rik-202ENSMUST00000165466 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms