Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms