Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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