Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Usp9yF8VPU6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Usp9yF8VPU6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Usp9yF8VPU6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Usp9yF8VPU6 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Usp9yF8VPU6 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Usp9yF8VPU6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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Usp9yF8VPU6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Usp9yF8VPU6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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Usp9yF8VPU6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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