Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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H2-M1F7CXU4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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