Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms