Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SmgcF6VRN1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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