Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Susd1E9Q3H4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms