Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc175E9PVB3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms