Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Nkx6-2D3Z4R4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nkx6-2D3Z4R4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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