Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms