Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmf1B9EKI3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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