Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms