Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uhrf1bp1B2KF50 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms