Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rtf1A2AQ19 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtf1A2AQ19 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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