Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Kiaa1109A2AAE1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms