Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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