Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm3839S4R1W1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3839S4R1W1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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