Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm26992S4R1A3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm26992S4R1A3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm26992S4R1A3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm26992S4R1A3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm26992S4R1A3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm26992S4R1A3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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