Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a3Q9QZS0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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